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ILLUMINA, INC.

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Illumina presenta una nueva prueba de investigación para abordar una de las infecciones más comunes en Estados Unidos

01/11/2022 | 14:00

Illumina, Inc. ha anunciado una nueva prueba de investigación para la identificación de patógenos genitourinarios y resistencia a los antimicrobianos. El panel de enfermedades infecciosas/resistencia a los antimicrobianos (ID/AMR) de patógenos urinarios de Illumina aplica la metagenómica de precisión para detectar y cuantificar los patógenos, incluidos los resistentes a los medicamentos que causan infecciones del tracto urinario (ITU) complicadas y recurrentes. Las infecciones del tracto genitourinario se encuentran entre las infecciones comunitarias y asociadas a la atención sanitaria más comunes, y el aumento de la resistencia a los medicamentos provoca una morbilidad y una mortalidad crecientes.

Este anuncio se produce tras el lanzamiento en octubre de dos pruebas de investigación que permiten la vigilancia de los virus de alto riesgo, como parte del firme compromiso de Illumina de apoyar la preparación mundial ante brotes epidémicos y pandémicos. En menos de 48 horas, UPIP, un panel basado en la secuenciación de próxima generación (NGS), detecta y cuantifica más de 170 organismos que pueden causar infecciones genitourinarias y más de 3700 marcadores AMR asociados a 18 clases de medicamentos diferentes. Combinado con el uso de Explify®, una plataforma de análisis de datos totalmente automatizada, este flujo de trabajo proporciona un perfil de infección completo entre microbios bacterianos, fúngicos, víricos y parasitarios.

En Estados Unidos, las ITU son una de las infecciones más comunes en la comunidad y en los pacientes hospitalizados; suponen una media de 10 millones de visitas al consultorio y un millón de hospitalizaciones al año. La prevalencia de la resistencia a los fármacos en los microorganismos causantes de la enfermedad (uropatógenos) va en aumento, y el tratamiento con antibióticos para la infección aguda o la profilaxis no suele prevenir las infecciones recurrentes. El UPIP también identifica más de 20 patógenos de transmisión sexual y su respectivo perfil antimicrobiano.

Los métodos de análisis actuales requieren el cultivo de la muestra de orina como primera línea de detección de las ITU y las ITS, pero muchos organismos no crecen en el cultivo y permanecen sin detectar. La UPIP detecta y cuantifica los uropatógenos comunes y poco reconocidos, pero cruciales, sin necesidad de realizar un cultivo. La UPIP también puede identificar bacterias de crecimiento lento y anaerobias relacionadas con las infecciones urinarias que suelen pasar desapercibidas en los métodos de detección tradicionales.

La metagenómica de precisión puede reducir de semanas a horas el tiempo necesario para obtener información crítica sobre los microbios. UPIP es el segundo panel de metagenómica de precisión de la plataforma Illumina Explify®. Sigue al panel de identificación/AMR de patógenos respiratorios basado en NGS (RPIP) lanzado en junio de 2020 en asociación con IDbyDNA.

El RPIP se centra en más de 280 patógenos respiratorios, incluidos el SARS-CoV-2, la gripe, el virus sincitial respiratorio, las bacterias, los hongos y más de 2000 marcadores de AMR. Ambos paneles de patógenos ofrecen un flujo de trabajo libre de cultivos, flexible y escalable en menos de 48 horas, lo que constituye una solución rápida y rentable para la detección de infecciones respiratorias y del tracto urinario en entornos de investigación clínica. Más allá de la utilización en investigación clínica, tanto el RPIP como el UPIP también pueden aportar valiosos conocimientos a la salud pública y a la vigilancia, utilizándose para controlar los patógenos respiratorios y genitourinarios, así como los marcadores de AMR en muestras de aguas residuales y medioambientales.

Los profesionales de la salud pública utilizan cada vez más la genómica para la vigilancia de epidemias y pandemias. La NGS ha demostrado ser un enfoque más flexible, rápido y completo en comparación con los métodos tradicionales de evaluación de agentes patógenos. Proporciona un método universal y sin cultivos para la caracterización y vigilancia de las enfermedades infecciosas.

Illumina se ha comprometido a apoyar la preparación y la respuesta a futuros brotes a gran escala y a prevenir pandemias. En octubre, lanzó el Panel de Vigilancia Viral (VSP), que ofrece la secuenciación del genoma completo y la caracterización de 66 virus, incluidos el SARS-CoV-2, la gripe, el RSV, la viruela del mono y el poliovirus, que representan un alto riesgo para la salud pública. El diseño de VSP permite a los investigadores y a los científicos de la salud pública vigilar múltiples virus de alto riesgo (tanto de ADN como de ARN) de forma proactiva, utilizando una variedad de tipos de muestras, incluidas las de aguas residuales, ambientales y postclínicas.

Paralelamente al VSP, Illumina lanzó el panel de pancoronavirus (Pan-CoV), que permite la detección y la secuenciación del genoma completo de 203 coronavirus conocidos y de más de 370 cepas de coronavirus animales y de nuevos coronavirus estrechamente relacionados. Con este panel, los investigadores de salud pública y zoonóticos pueden detectar y caracterizar los virus que tienen el potencial de pasar de la fauna salvaje y los animales domésticos a las poblaciones humanas.


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