Bruker Corporation ha anunciado avances en inmunopeptidómica, glicoproteómica y otros flujos de trabajo de proteómica 4D habilitados para CCS. Los rápidos avances en las soluciones de investigación proteómica, glicómica y peptidómica profundas y a escala complementan otras herramientas de ciencias de la vida líderes en rendimiento para la era posgenómica de Bruker. Juntas permiten la investigación molecular y de biología celular post-genómica, con conocimientos clave sobre la biología de las enfermedades y los biomarcadores para el diagnóstico molecular de próxima generación y el descubrimiento de fármacos.

Los avances presentados en US HUPO incluyen la secuenciación de novo mejorada con aprendizaje automático (Novor V2.0), un novedoso software gemelo digital de monitorización de alto rendimiento (TwinScape), el nuevo método glyco-PASEF para el análisis de glicopéptidos de alta sensibilidad y el acceso a Spectronaut 18 para los usuarios de BrukerProteoScape, un software impulsado por GPU para la proteómica 4D en tiempo real, ahora con acceso a las búsquedas sin biblioteca de Biognosys directDIA. A. Avanzando en la investigación de la inmunoterapia del cáncer: Bruker mejora sus sistemas timsTOF HT y timsTOF Ultra con el nuevo software Novor v2.0 para el perfilado inmunopeptidómico de novo. Novor v2.0, desarrollado en colaboración con Rapid Novor Inc., fue entrenado en >1.400.000 espectros mapeados a >150.000 péptidos HLA para la investigación en pequeñas cantidades de material de pacientes derivado de biopsias con aguja fina.

B. Rendimiento máximo del timsTOF utilizando TwinScape: TwinScape es un nuevo motor de monitorización del rendimiento y control de calidad digital-twin, que aprovecha los estándares de péptidos iRT para respaldar un rendimiento pico sostenido en la preparación de muestras y LC-MS. Para los estudios multiómicos sinérgicos en la era posgenómica, se requiere una combinación de profundidad de cobertura, robustez y cuantificación escalable. TwinScape permite realizar estudios controlados de mayor envergadura y una comparabilidad válida entre laboratorios. C. Nuevo glyco-PASEF para el análisis de glicopéptidos 4D de sensibilidad ultra alta: Bruker presenta el novedoso método timsTOF glyco-PASEF con filtrado poligonal desarrollado con el Grupo Heck de la Universidad de Utrecht, el software GlycoScape desarrollado en colaboración con el Grupo Van Gool de la Universidad de Radboud, y el software MSFragger-Glyco desarrollado por el Grupo Nesvizhskii de la Universidad de Michigan.

D. Avances en el software para dia-PASEF: La última versión de Bruker ProteoScape pone a su disposición un módulo Spectronaut 18 para el análisis dia-PASEF, lo que permite obtener resultados en tiempo real utilizando la computación GPU, incluyendo directDIA para búsquedas sin bibliotecas. Bruker ProteoScape también actualiza ahora el software TIMS DIA-NN a la versión 3.0 con una precisión de cuantificación mejorada.