El ministerio dijo que una fuerza naval ucraniana de más de 250 efectivos intentó desembarcar en la costa de un lago cercano a la planta de Zaporizhzhia, en el sur de Ucrania, alrededor de las 11 de la noche hora local (2000 GMT) del viernes.
"A pesar de la presencia de representantes del Organismo Internacional de Energía Atómica (OIEA) en la central nuclear de Zaporizhzhia, el régimen de Kiev intentó una vez más apoderarse de la planta", dijo el Ministerio de Defensa.
Rusia dijo que sus fuerzas frustraron el ataque con ataques de helicópteros militares y aviones de combate, destruyendo 20 naves ucranianas y haciendo que otras se dispersaran y cancelaran el ataque.
Reuters no pudo verificar el informe.
Kiev y Moscú han intercambiado acusaciones sobre los ataques a la central, la mayor estación de energía nuclear de Europa, en los últimos meses.
La planta fue capturada por las fuerzas rusas en marzo, pero está conectada a la red eléctrica ucraniana y sigue siendo operada por personal ucraniano.
El OIEA envió una misión a la planta nuclear esta semana en medio de la preocupación de que una escalada pueda desencadenar un desastre nuclear al estilo de Chornobyl en el continente europeo.
Tanto Rusia como Ucrania han dicho que la situación es grave y que el riesgo de una catástrofe nuclear es alto. Ucrania y Occidente han dicho que Rusia está utilizando el lugar como base de armas pesadas en un movimiento para disuadir a Ucrania de disparar contra ella.
El ministro de Defensa ruso, Sergei Shoigu, negó el viernes que Rusia tuviera armas pesadas en la central o en sus proximidades y acusó a Ucrania de cometer "terrorismo nuclear" con sus ataques a la instalación.
Un representante del régimen instalado por Rusia en la Zaporizhzhia ocupada dijo que la situación en la central estaba en calma el sábado por la mañana.
