Singular Genomics Systems, Inc. ha presentado el secuenciador espacial G4X. El G4X está diseñado para ofrecer secuenciación directa in situ de alto rendimiento de ARN (Direct-Seq?), transcriptómica dirigida y perfiles proteómicos a partir de tejidos fijados en formol e incluidos en parafina (FFPE). El G4X compartirá la misma plataforma que el secuenciador G4® existente y se espera que sea el primer instrumento de doble uso del sector que ofrezca tanto la NGS tradicional como capacidades de secuenciación espacial basada en tejidos.

Con la incorporación de la multiómica de alto rendimiento y la novedosa tecnología Direct-Seq a su cartera con el G4X, Singular se posiciona para convertirse en la única empresa del mundo que ofrece secuenciación espacial in situ de tejidos y NGS en el mismo instrumento. El secuenciador espacial G4X está diseñado para ofrecer capacidades novedosas, flujos de datos apilables y un rendimiento sin precedentes para el perfilado espacial de tejidos. Sus novedosas capacidades incluirán Direct-Seq, que es la secuenciación de moléculas de ARN in situ y tiene el potencial de abrir nuevas áreas de descubrimiento científico.

Además, el G4X ofrecerá lecturas de transcritos dirigidos, proteínas dirigidas y una tinción fluorescente H&E, todo ello en la misma muestra de tejido. Y por último, esta combinación de modalidades de lectura se ofrecerá a una escala sin precedentes. Con 40 cm2 de área flexible de obtención de imágenes y tiempos de ejecución de un solo día, el sistema G4X permitirá a los laboratorios procesar 20 veces más muestras por semana que las tecnologías existentes.

Los kits iniciales del G4X soportarán la transcripción, la proteómica y ofrecerán una tinción fluorescente H&E. El sistema está diseñado para dar cabida a un gran número de muestras y leerá cientos de dianas génicas y docenas de proteínas en la misma sección de tejido. El contenido estará disponible en paneles fijos o personalizables para el cliente.

Los futuros kits del G4X también serán compatibles con Direct-Seq, que está diseñado para leer directamente regiones variables de ARN, como mutaciones en puntos calientes del cáncer, ARN guía en cribas CRISPR o secuencias de receptores de células B y T. Se espera que la capacidad de realizar la secuenciación directa del ARN dentro de células y tejidos aporte una nueva y potente modalidad de lectura para la patología molecular in situ. Direct-Seq estará disponible inicialmente como servicio, con planes para un lanzamiento más amplio poco después.

Singular anunció previamente un programa de acceso a la tecnología para el PX, cuyos aprendizajes se han aplicado al desarrollo del G4X. A través de su programa de acceso a la tecnología, Singular ha estado colaborando activamente con instituciones líderes para generar datos sobre el G4X y demostrar su aplicabilidad en áreas de investigación críticas. Características clave previstas del G4X?

Secuenciador espacial: Rendimiento líder en la industria: Se espera que un área de procesamiento de imágenes de 40 cm2 por corrida a través de cuatro celdas de flujo espacial aumente drásticamente el rendimiento de las muestras al tiempo que se mantiene la flexibilidad para corridas más pequeñas. Direct-Seq: Secuenciación in situ de ARN, diseñada para secuenciar regiones génicas variables directamente dentro de células y tejidos, con aplicaciones potenciales en inmunología, inmuno-oncología, investigación del cáncer y edición génica. Transcritos: Cientos de transcritos de genes, que estarán disponibles en paneles curados y selección personalizada de dianas génicas.

Proteínas: Docenas de proteínas, que estarán disponibles en paneles curados y selección personalizada de objetivos proteicos. H&E fluorescente: Tinción H&E fluorescente superpuesta con transcritos y proteínas en la misma muestra de tejido. Rapidez: Con un proceso especializado de transferencia de tejidos, un flujo de trabajo racionalizado de preparación de muestras y secuenciación de alta velocidad en un solo día, los usuarios podrán pasar de la muestra al descubrimiento en sólo tres días.

Rentable: Con su rendimiento sin precedentes, el G4X reducirá significativamente el coste por muestra a menos de la mitad del de otros enfoques alternativos, haciendo más accesible la multiómica espacial. El sistema se cotiza a 495.000 dólares, se espera que las actualizaciones del G4X estén disponibles para los clientes del G4 a finales de 2024, junto con un panel inmuno-oncológico inicial de aproximadamente 300 transcritos de genes, 10-15 proteínas y la posibilidad de personalizar el contenido. Se espera que Direct-Seq y paneles adicionales se lancen en una fecha posterior.

Singular también tiene previsto ofrecer servicios de acceso a la tecnología de secuenciación espacial G4X a partir del segundo trimestre de 2024. La empresa tiene previsto compartir más información y datos en la próxima reunión general anual de la AGBT en Orlando, Florida (del 5 al 8 de febrero de 2024).