La visita se produce en un momento en que los dos vecinos musulmanes intentan recomponer sus lazos tras los ataques militares sin precedentes de este año.
"Ambas partes acordaron aumentar el volumen del comercio bilateral a 10.000 millones de dólares estadounidenses en los próximos cinco años", declaró la oficina de Sharif en un comunicado tras una rueda de prensa conjunta.
"También acordaron cooperar en el desarrollo de enfoques conjuntos para hacer frente a los desafíos comunes, incluida la amenaza del terrorismo", añadió el comunicado.
No se disponía de cifras oficiales sobre el comercio anual actual. El medio de comunicación local Business Recorder, citando al entonces embajador de Irán en Pakistán, informó el año pasado de un comercio bilateral por valor de más de 2.000 millones de dólares.
Raisi, que iba acompañado de una delegación que incluía al ministro de Asuntos Exteriores del país y a miembros del gabinete, visitará a continuación la ciudad oriental de Lahore y la ciudad portuaria meridional de Karachi.
Las principales autopistas de Islamabad fueron bloqueadas como parte de las medidas de seguridad para la llegada de Raisi, mientras que el gobierno declaró un día festivo en Karachi y Lahore.
Aunque la visita de Raisi es un paso clave hacia la normalización de los lazos con Islamabad, el Líder Supremo de Irán, el ayatolá Ali Jameni, y no el presidente, tiene la última palabra en asuntos de Estado como la política nuclear.
Las tensiones también han sido elevadas en Oriente Próximo después de que Irán lanzara un ataque sin precedentes contra Israel hace una semana y de que el centro de Irán sufriera a su vez lo que, según fuentes, fue un ataque israelí el viernes.
Pakistán ha pedido previamente una desescalada a "todas las partes".
Sharif alabó a Irán en la rueda de prensa por adoptar una postura firme ante la situación humanitaria en Gaza y pidió el cese inmediato de las hostilidades en esa zona.
Sharif hizo un llamamiento a los países musulmanes para que se unan y alcen la voz por el fin del conflicto.
Pakistán e Irán han tenido una historia de relaciones rocambolescas a pesar de una serie de pactos comerciales, estando Islamabad históricamente más cerca de Arabia Saudí y Estados Unidos.
Su acuerdo más destacado es un acuerdo estancado de suministro de gas firmado en 2010 para construir un gasoducto desde el yacimiento iraní de Fars del Sur hasta las provincias meridionales paquistaníes de Baluchistán y Sindh.
A pesar de la acuciante necesidad de gas de Pakistán, Islamabad aún no ha iniciado la construcción de su parte del gasoducto, alegando el temor a las sanciones estadounidenses, una preocupación que Teherán ha rechazado.
Pakistán dijo que pediría exenciones a EE.UU., pero Washington ha dicho que no apoya el proyecto y ha advertido del riesgo de sanciones al hacer negocios con Teherán.
A pesar de enfrentarse a posibles sanciones por incumplimiento de contrato que ascienden a miles de millones de dólares, Islamabad dio recientemente luz verde a la construcción de un tramo de 80 km (50 millas) del oleoducto.
