Bionano Genomics, Inc. ha anunciado el lanzamiento de múltiples productos nuevos y avances para su flujo de trabajo de mapeo genómico óptico que ofrecen una mayor robustez en la preparación de muestras, un menor tiempo de respuesta para el etiquetado y la obtención de imágenes de ADN, y mejoras en el rendimiento y las métricas de calidad. Las nuevas versiones de los kits de preparación de muestras, los chips y el software de los instrumentos de Bionano responden a los comentarios de los clientes y pueden mejorar el rendimiento en aplicaciones rutinarias de análisis genómico de mayor volumen. Los kits de preparación de muestras de Bionano se utilizan para extraer y etiquetar ADN de peso molecular ultraalto (UHMW) para su uso en el sistema Saphyr.

Estos kits están optimizados para realizar aplicaciones de OGM de Bionano en una gran variedad de tipos de muestras. Los kits de la Generación 2 serán compatibles con muestras de sangre, líneas celulares y aspirados de médula ósea, y se esperan versiones para muestras de tejidos y tumores más adelante en 2023. Los kits Bionano Prep SP-G2 (SP-G2) y Bionano Prep Direct Label and Stain (DLS-G2) también han aumentado de tamaño, pasando de kits de 10 reacciones a kits de 12 reacciones, una mejora que se adapta mejor a los consumibles para chips de la empresa.

El kit SP-G2 mejora el aislamiento del ADN UHMW y permite mayores tasas de éxito de las muestras, menos errores del usuario y más datos generados por serie. Una de las principales mejoras en la preparación de las muestras es la posibilidad de aislar ADN de mayor calidad, especialmente en el caso de muestras marginales. El nuevo protocolo también puede eliminar las limitaciones de tiempo y proceso, haciendo que el paso de lisis sea más fácil de usar y esté mejor optimizado para corridas con diferentes tipos de muestras, lo que permite a los usuarios procesar hasta seis muestras simultáneamente.

Estas mejoras en la química pueden traducirse, en última instancia, en un mayor rendimiento del ADN para generar más datos por serie de muestras. Además, un derivado del kit SP-G2 es compatible con el aislamiento automatizado de ADN UHMW Long String Vantage de Hamilton. El kit DLS-G2 de Bionano permite completar el etiquetado en tan sólo cinco horas para cargar el ADN etiquetado en el mismo día en el instrumento Saphyr.

Esta mejora química puede permitir una reducción global del tiempo de respuesta (o de la muestra a la respuesta) y posibilitar la obtención de respuestas de alta profundidad para muestras de cáncer en tan sólo tres días. Bionano ha aumentado la estabilidad de los reactivos de nueve meses a un año para el kit DLS-G2, para que sea coherente con el kit SP-G2, lo que puede suponer un menor desperdicio de reactivos y una mayor utilidad durante un periodo de tiempo más largo. El Saphyr Chip G3.3, una nueva versión del software de control del instrumento (ICS v5.3) y una nueva versión de Bionano Access (v.1.7.2), permiten mejorar el rendimiento y las tasas de éxito cuando se cargan dos Saphyr Chips en paralelo, lo que permite procesar de tres a seis muestras más por semana de trabajo.

Estas mejoras en el rendimiento son el resultado de una reducción de la evaporación de las muestras y mejoran la fiabilidad de la carga de las muestras y el rendimiento del instrumento Saphyr. Un mayor rendimiento también se traduce en mejores rendimientos en la primera pasada y puede eliminar el riesgo de agotamiento de la muestra cuando se trabaja con muestras complejas y de mayor tiempo de escaneado, como las de la investigación del cáncer o el bioprocesamiento celular. La compatibilidad del ICS v5.3 con el Saphyr Chip G3.3 mejora la coherencia del rendimiento en todas las pasadas, así como la solidez de la alineación.