NS WIND DOWN CO., INC. NanoString Technologies, Inc. ha anunciado la publicación de nuevos datos generados por el CosMxo Spatial Molecular Imager (SMI). Estos datos se generaron a partir de muestras de hígado humano fijadas en formol e incluidas en parafina (FFPE) y muestran la calidad de datos del CosMx SMI, la mejor de su clase. El conjunto de datos pone de relieve la alta sensibilidad del CosMx SMI, con capacidad para detectar y cuantificar una media de 1.150 transcritos por célula y para maximizar los conocimientos biológicos mediante la detección de 676 genes únicos.
El conjunto de datos también representa la alta especificidad de CosMx SMI, con más del 99% de recuentos identificados en genes diana. CosMx SMI permite obtener imágenes de alta resolución de más de 1.000 ARN y más de 64 analitos proteínicos dentro de secciones de tejido entero morfológicamente intactas. El instrumento CosMx permite a los investigadores visualizar y cuantificar la expresión de genes y proteínas a resoluciones unicelulares y subcelulares dentro de muestras de tejido fresco congelado y FFPE.
Mediante un enfoque multimodal, que incluye la obtención de imágenes de proteínas, CosMx SMI ofrece la mejor segmentación celular de su clase. Este análisis in situ de alta complejidad también permite a los investigadores realizar análisis de tipificación celular, de estado celular, funcionales y de interacción célula-célula en un solo experimento generando atlas celulares de alta resolución. NanoString utilizó el CosMx SMI para caracterizar tejido FFPE hepático de pacientes normales y con carcinoma hepatocelular.
Los datos CosMx de hígado humano proporcionan un mapa de expresión subcelular de 1.000 genes y un atlas de tejido unicelular que categoriza cada célula del tejido como uno de los 18 tipos celulares únicos. El conjunto de datos completo consta de más de 800.000 células individuales y ~700 millones de transcripciones, y un atlas tisular unicelular en un área de ~180 mm2 de tejido hepático. El análisis de altoplex proporcionó una visión profunda de los cambios celulares y tisulares que se producen en el cáncer, incluida la infiltración de diversas células inmunitarias.
