El ejército israelí dijo que la mujer había corrido hacia los soldados en un puesto de control y no hizo caso a las llamadas o disparos de advertencia para que se detuviera.
Los militares dijeron que no se había encontrado ningún arma en ella y que el incidente estaba siendo investigado.
Las autoridades dijeron que los soldados también mataron a una segunda mujer palestina ese mismo día después de que apuñalara a un soldado.
En la ciudad israelí de Kfar Saba, los dolientes enterraron el domingo a Eytam Magini, de 27 años, asesinado la semana pasada por un pistolero palestino.
Las fuerzas israelíes han estado en alerta máxima tras los ataques que han matado a 14 personas en Israel desde finales de marzo.
Más de 20 palestinos, muchos de ellos militantes armados, han muerto a manos de las fuerzas israelíes desde enero, mientras que los palestinos han denunciado un aumento de la violencia por parte de los colonos israelíes en Cisjordania.
En declaraciones públicas a su gabinete el domingo, el primer ministro israelí, Naftali Bennett, dijo que las fuerzas de seguridad estaban combatiendo agresivamente lo que describió como una "nueva ola de terrorismo".
"Iremos donde sea necesario, en cualquier momento, para cortar estos actos de terror. El Estado de Israel ha pasado a la ofensiva".
Las fuerzas de defensa israelíes publicaron el domingo imágenes de redadas nocturnas en Cisjordania, en las que aparecen registrando casas y deteniendo a hombres con los ojos vendados.
El Ministerio de Sanidad palestino dijo que una redada israelí en la ciudad cisjordana de Yenín dejó 13 heridos y un muerto.
La Yihad Islámica Palestina reivindicó al hombre muerto como miembro del grupo militante.
La redada tenía como objetivo la casa de un pistolero palestino que mató a Magini y a otras dos personas en un bar de una concurrida calle de Tel Aviv antes de ser abatido por las fuerzas de seguridad la semana pasada.
