El Nikkei cerró con una caída del 0,33% hasta los 32.166,48 puntos, tras una apertura al alza del 0,75%.
"Los inversores vendieron acciones vinculadas a la economía, o acciones de valor, para asegurar beneficios mientras se preparaban para una desaceleración económica", dijo Ikuo Mitsui, gestor de fondos de Aizawa Securities.
"Hubo una señal de que los inversores empezaron a cambiar su objetivo de las acciones de valor a las de crecimiento, como las relacionadas con los chips, ante la preocupación de que el endurecimiento monetario de EE.UU. pudiera perjudicar a la economía". El mercado de hoy fue un reflejo de ese movimiento", añadió Mitsui.
La venta masiva se produjo después de que el Nikkei subiera más de un 6% en una racha de cuatro sesiones de crecimiento que duró hasta el lunes.
Las refinerías de petróleo perdieron un 6,11% y se convirtieron en el peor valor entre los 33 subíndices industriales de la Bolsa de Tokio. Eneos Holdings cayó un 6,85%.
Los exploradores energéticos perdieron un 5,29%.
El índice bancario, otro indicador del rendimiento de los valores de valor, perdió un 4,75%.
El índice Topix, más amplio, perdió un 1,16% hasta los 2.305,95, y el Mitsubishi UFJ Financial Group perdió un 4,17%.
El índice de valor del Topix perdió un 2,07%, mientras que su índice de crecimiento cedió un 0,2%.
El propietario de la marca Uniqlo, Fast Retailing, uno de los valores de crecimiento, subió un 1,22% y fue el mayor apoyo para el Nikkei, mientras que el fabricante de equipos de pruebas de chips Advantest subió un 1,93%.
Nintendo se disparó un 6,09% después de que la empresa de videojuegos elevara su previsión de beneficios operativos en un 11% para el ejercicio fiscal que finaliza en marzo.
Mazda Motor subió un 10,39% después de que el fabricante de automóviles elevara su previsión de beneficios operativos anuales gracias a la debilidad del yen. (Reportaje de Junko Fujita; Edición de Subhranshu Sahu y Varun H K)