Ultima Genomics, Inc. ha dado a conocer una amplia colaboración con NVIDIA que aprovecha el análisis acelerado por IA en múltiples etapas del proceso de secuenciación y análisis del ADN. La colaboración incluye el uso de las GPU de NVIDIA para el aprendizaje profundo en la fotometría y la llamada de bases y pronto incluirá la aceleración de la llamada de variantes. A lo largo de los últimos cinco años, Ultima Genomics ha desarrollado una arquitectura de secuenciación fundamentalmente nueva, diseñada para superar los enfoques convencionales, que incluye una ingeniería de células de flujo, una química de secuenciación y un aprendizaje automático completamente diferentes.

Ultima se encuentra actualmente en un programa de acceso temprano para el UG 100™, su primer instrumento de secuenciación de nueva generación de alto rendimiento que utiliza esta nueva tecnología, que permite a los clientes generar datos de secuenciación de alta calidad a un coste de 1 $/Gb. La genómica se une a la IA: el instrumento Ultima utiliza las GPU A30 de NVIDIA con la plataforma de cálculo de IA NVIDIA Clara [2] para ofrecer análisis primarios y secundarios de gran precisión y aceleración a los clientes que quieran realizar análisis genómicos a escala. Ultima ha anunciado por separado asociaciones para desarrollar pipelines de llamadas de variantes de la línea germinal específicos de Ultima para DeepVariant de Google.

Estos modelos personalizados pueden ejecutarse dentro de NVIDIA Clara Parabricks, que acelera estas y otras aplicaciones para el análisis secundario. Los pipelines computacionales de NVIDIA Clara Parabricks emplean los stacks de CUDA, HPC, IA y análisis de datos de NVIDIA para ofrecer librerías, pipelines y flujos de trabajo de aplicaciones de referencia acelerados en la GPU para análisis primarios, secundarios y terciarios. Las soluciones listas para usar se combinan con un conjunto de herramientas para apoyar el desarrollo de nuevas aplicaciones con el fin de satisfacer las necesidades en rápida evolución de los laboratorios de genómica de alto rendimiento.